在前面的混凝系统中，采用了投加磁种的方式以使凝聚所形成的絮体带上磁性、由于投加磁种的过程中是连续的。在污水处理系统的磁种回收中，磁种也将成为运行费用的一部分，为了节约资源同时也考虑到吨水处理的运行成本，开发研究了磁种回收技术，将投加在污水中的磁种回收在利用。
磁种回收系统主要由磁种回收机和投加的磁种。超磁分离机分离处理的渣是磁种和悬浮物在药剂的作用下形成的絮团，它由超磁分离机的螺旋输送装置输送出设备，通过管道自流进入磁种回收系统，在高速搅拌中，切哥叶片在高速搅拌下进行分散。磁种和悬浮物被打散分离后，混合在水里溢流斤磁鼓。磁种在被经过特殊设计的磁路，磁鼓连续旋转，将从混合液分选出来的磁种回收到磁种搅拌箱里，非磁性的悬浮物随之水流由排泥管排出，清理干净的磁鼓进行下一个循环，此过程完成磁种回收。
磁种在磁种搅拌箱内通过补水口用自来水稀释城一定浓度的容液，在混合搅拌机的作用下连续混合均匀，磁种回收技术配套的磁种泵则定量地将磁种溶液输送至混凝系统的混凝箱内，从而完成磁种回收在利用的技术。
